• Trwają zapisy na kurs   NGS w badaniach regulacji genów

    Więcej
  • ideas4biology.com               Analiza danych biologicznych

    Więcej
  • ideas4biology.com                Kursy bioinformatyczne

    Więcej
  • ideas4biology.com                Biologiczne bazy danych

    Więcej


Łatwe programowanie dla biologów w języku Python

Kurs odbędzie się w dniach 2-3 grudnia 2017 r. na Wydziale Biologii Uniwersytetu im. Adama Mickiewicza w Poznaniu (ul. Umultowska 89).



Oto zagadnienia, które zostaną poruszone podczas kursu:

Poznajemy język Python

W tej części kursu dowiemy się czym jest język Python i jak możemy go wykorzystać w biologii. Poznamy podstawowe instrukcje (if, while oraz for) i struktury danych (lista i słownik). Napiszemy pierwszy program. Nauczymy się odczytywać dane z pliku i dokonywać ich obróbki. Poznamy także podstawowe funkcje języka Python i dowiemy się jak tworzyć własne funkcje.


Pracujemy na danych biologicznych: BioPython

Poznamy BioPythona, bioinformatyczną bibliotekę języka Python. Dowiemy się, jak parsować biologiczne formaty plików (m.in. FASTA i GenBank). Nauczymy się analizować pliki wynikowe programów BLAST i BLAT. Ponadto połączymy się zdalnie z biologicznymi bazami danych by efektywnie je przeszukiwać i pobierać z nich dane.


Realizujemy zaawansowane zadania

Nauczymy się tworzyć logo sekwencji; będziemy pracować z plikami zawierającymi adnotacje (BED, GTF); wykonamy analizy statystyczne i dowiemy się jak tworzyć zaawansowane wykresy; wykonamy podstawową obróbkę danych NGS.


Projekt

Podczas kursu każdy uczestnik wykona dwa projekty pozwalające sprawdzić zdobytą wiedzę i umiejętności. Będą one polegały na napisaniu i uruchomieniu programów w języku Python.


Zachęcamy do rejestrowania się. Koszt uczestnictwa wynosi 700 zł.
Od uczestników kursu nie jest wymagana umiejętność programowania.
Informacje organizacyjne można znaleźć na stronie FAQ.