• Trwają zapisy na kurs   NGS w badaniach regulacji genów

    Więcej
  • ideas4biology.com               Analiza danych biologicznych

    Więcej
  • ideas4biology.com                Kursy bioinformatyczne

    Więcej
  • ideas4biology.com                Biologiczne bazy danych

    Więcej


Wprowadzenie do obróbki i analizy danych NGS

Kurs odbędzie się 3 marca 2017 r. na Wydziale Biologii UAM w Poznaniu (ul. Umultowska 89).


Przeznaczony dla wszystkich osób, które chcą zapoznać się z podstawowymi zagadnieniami związanymi z sekwencjonowaniem nowej generacji. Niezależnie od tego, czy planują Państwo analizować dane samodzielnie, czy współpracować ze specjalistami w tej dziedzinie, na pewno warto wzbogacić swoją wiedzę o tego typu zagadnienia. Od uczestników kursu nie jest wymagana umiejętność programowania.



Oto zagadnienia, które zostaną poruszone podczas kursu:

Wyniki sekwencjonowania w technologii NGS

W jaki sposób dane powstają, są przechowywane, obrabiane i zastosowane w przykładowych projektach badawczych. Poznamy bazy danych i formaty plików oraz przeprowadzimy kontrolę jakości danych NGS (FastQC, FASTX Toolkit, Trimmomatic).


Mapowanie

Mapowanie krótkich odczytów pochodzących z technologii DNA–Seq (Bowtie, BWA) oraz RNA–Seq (Tophat, STAR). Poznamy rózne strategie i metody, ich wady i zalety.


Seminarium

W ramach seminarium porozmawiamy o NGS i o zastosowaniu tej technologii w Państwa projektach.




Dla kogo przeznaczony jest ten kurs?
Kurs skierowany jest dla wszystkich osób związanych z biologią, biotechnologią, bioinformatyką (ale nie tylko), które chcą się nauczyć jak przeprowadzić kontrolę jakości danych pochodzących z sekwencjonowania nowej generacji oraz jak mapować odczyty do genomu bądź transkryptomu i przeprowadzać operacje na wynikach mapowania.


Czy sobie poradzisz? Na pewno!
Kurs przygotowany jest tak, aby każdy, nawet najbardziej początkujący uczestnik, mógł sobie bez problemu poradzić z wykonaniem wszystkich zadań. Nie jest wymagana umiejętność programowania.


Zachęcamy do rejestrowania się. Koszt uczestnictwa wynosi 400 zł.
Informacje organizacyjne można znaleźć na stronie FAQ.