• Trwają zapisy na kurs   NGS w badaniach regulacji genów

    Więcej
  • ideas4biology.com               Analiza danych biologicznych

    Więcej
  • ideas4biology.com                Kursy bioinformatyczne

    Więcej
  • ideas4biology.com                Biologiczne bazy danych

    Więcej


Wprowadzenie do analizy danych RNA-Seq

Kurs odbędzie się w dniach 21-22 października 2017 r. na Wydziale Biologii Uniwersytetu im. Adama Mickiewicza w Poznaniu (ul. Umultowska 89).


Zachęcamy do rejestrowania się. Koszt uczestnictwa wynosi 850 zł.
Informacje organizacyjne można znaleźć na stronie FAQ.





Jakie zagadnienia zostaną omówione i przećwiczone?
  1. Krótkie wprowadzenie do NGS i RNA-Seq.
  2. Kontrola jakości danych.
  3. Mapowanie odczytów, szacowanie ekspresji genów i transkryptów.
  4. Analiza ekspresji różnicowej, wizualizacja wyników.
  5. Składanie transkryptów de novo.
  6. Składanie transkryptów ab initio.
  7. Analiza małych RNA, w tym identyfikacja mikroRNA.


Dla kogo przeznaczony jest ten kurs?
Kurs skierowany jest dla wszystkich osób związanych z biologią, biotechnologią, bioinformatyką (ale nie tylko), które chcą się nauczyć jak analizować wielkoskalowe dane pochodzące z sekwencjonowania transkryptomów (RNA-seq).


Jakie będą efekty?
Po ukończeniu kursu, uczestnik powinien wiedzieć jakie źródła i formaty danych najczęściej spotykamy, jak skontrolować jakość odczytów, zmapować je do genomu lub transkryptomu.
Dodatkowo będzie również potrafił oszacować ekspresję genów i transkryptów oraz przeprowadzić analizę ekspresji różnicowej. Uczestnicy nauczą się jak podejść do składania transkryptomów i analiz małych regulatorowych RNA. Ważnym elementem będzie też tworzenie i interpretowanie wykresów ułatwiających analizę danych.


Czy sobie poradzisz? Na pewno!
Kurs przygotowany jest tak, aby każdy, nawet najbardziej początkujący uczestnik, mógł sobie bez problemu poradzić z wykonaniem wszystkich zadań. Nie jest wymagana umiejętność programowania.
Wskazana znajomość podstawowych zagadnień z biologii molekularnej i sekwencjonowania.